คณะเศรษฐศาสตร์ เป็นหน่วยงานที่ได้รับบรรจุตามแผนพัฒนาการศึกษาระดับอุดมศึกษา ระยะที่ 11 (พ.ศ.2555 - 2559) ของมหาวิทยาลัยขอนแก่น เป็นส่วนงานระดับคณะ ตามพระราชบัญญัติการบริหารงานส่วนงานภายในของสถาบันอุดมศึกษา พ.ศ.2550 มาตรา 4 และประกาศคณะกรรมการอุดมศึกษา เรื่องหลักเกณฑ์การจัดตั้งส่วนงานภายในของสถาบันอุดมศึกษา พ.ศ.2555 โดยกระบวนการจัดตั้งคณะเศรษฐศาสตร์มีความก้าวหน้าตามลำดับ พร้อมกับมหาวิทยาลัยขอนแก่น ที่ได้ปรับเปลี่ยนสถานะเป็นมหาวิทยาลัยในกำกับของรัฐ มหาวิทยาลัยขอนแก่น จึงมี ประกาศมหาวิทยาลัยขอนแก่น ฉบับที่ 1765/2558 ลงวันที่ 25 กรกฎาคม 2558 เรื่องการจัดตั้งส่วนงานของมหาวิทยาลัยขอนแก่น ที่กำหนดให้มีส่วนงานต่าง ๆ รวมทั้งคณะเศรษฐศาสตร์ และมีการประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่ม 132 ตอนพิเศษ 186 ง ลงวันที่ 13 สิงหาคม 2558 คณะเศรษฐศาสตร์ จึงมีสถานะเป็นหน่วยงานระดับคณะของมหาวิทยาลัยขอนแก่น จากนั้น มหาวิทยาลัยขอนแก่นได้ ประกาศมหาวิทยาลัยขอนแก่น ฉบับที่ 125/2559 ลงวันที่ 4 กุมภาพันธ์ 2559 เรื่องการดำเนินการบริหารจัดการคณะเศรษฐศาสตร์ ให้ตัดโอนหลักสูตร นักศึกษา บุคลากร และทรัพยากรดำเนินการที่สำคัญให้สังกัดคณะเศรษฐศาสตร์ และคณะได้จัดตั้งสำนักงานคณบดีเพื่อให้บริการเป็นครั้งแรก ณ อาคาร 1 ชั้น 4 คณะวิทยาการจัดการ เป็นสำนักงานชั่วคราวในการดำเนินงานระยะแรก

ด้วยสถานการณ์การรวมตัวของประชาคมอาเซียน และการขยายตัวของเศรษฐกิจในภูมิภาค ที่ทำให้เกิดความต้องการองค์ความรู้เชิงลึกในการพัฒนาเศรษฐกิจของอนุภาคลุ่มน้ำโขง และความต้องการบุคลากรที่มีความรู้ความสามารถ มีความเข้าใจลักษณะเฉพาะของการเติบโต และปัญหาเชิงลึกในภูมิภาค